Des suivis quotidiens sont réalisés à l'usine afin de vérifier la qualité de l'eau qui est distribuée aux consommateurs. Certains éléments sont analysés au laboratoire de l'usine chaque jour : fer, manganèse, ammonium, matières organiques... D'autres sont analysés par le laboratoire QUALYSE chaque semaine : nitrite, bactéries, phosphore, pesticides.
En parallèle, des suivis de la qualité de l'eau brute (eau du lac) sont réalisés afin d'ajuster au mieux les traitements permettant la potabilisation de l'eau. La préservation de la qualité de l'eau représente également un enjeu économique : des eaux brutes avec moins de nutriments et de polluants sont une nécessité pour satisfaire les besoins à long terme dans des conditions économiquement acceptables.
Des suivis sur les rivières qui alimentent le lac sont aussi régulièrement mis en oeuvre, ils permettent d'identifier plus précisément d'éventuelles sources de pollution sur le bassin.
Dans le cadre du contrat territorial de l’aire d’alimentation du captage du cébron, signé en 2014, des objectifs sur la qualité de l’eau brute ont était fixés :
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